Paket: dialign-tx (1.0.2-15)

[ Källkod: dialign-t  ]

Segment-based multiple sequence alignment

DIALIGN-TX is a command line tool to perform multiple alignment of protein or DNA sequences. It is a complete reimplementation of the segment-base approach including several new improvements and heuristics that significantly enhance the quality of the output alignments compared to DIALIGN 2.2 and DIALIGN-T. For pairwise alignment, DIALIGN-TX uses a fragment-chaining algorithm that favours chains of low-scoring local alignments over isolated high-scoring fragments. For multiple alignment, DIALIGN-TX uses an improved greedy procedure that is less sensitive to spurious local sequence similarities.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Behöver ett märke till

Andra paket besläktade med dialign-tx

• dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-15)

  Segment-based multiple sequence alignment (data files)

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Hämta dialign-tx

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	104,2 kbyte	275,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	85,5 kbyte	223,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	89,3 kbyte	210,0 kbyte	[filförteckning]
armel	75,1 kbyte	198,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	66,8 kbyte	142,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	95,7 kbyte	211,0 kbyte	[filförteckning]
i386	79,5 kbyte	210,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	151,4 kbyte	447,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	66,0 kbyte	194,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	99,9 kbyte	278,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	93,3 kbyte	275,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	93,0 kbyte	275,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	106,1 kbyte	187,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	73,6 kbyte	202,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	91,8 kbyte	210,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	84,4 kbyte	1.044,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	82,1 kbyte	206,0 kbyte	[filförteckning]