Pakiet: dialign-tx (1.0.2-15 i inne)

[ Pakiet źródłowy: dialign-t  ]

Segment-based multiple sequence alignment

DIALIGN-TX is a command line tool to perform multiple alignment of protein or DNA sequences. It is a complete reimplementation of the segment-base approach including several new improvements and heuristics that significantly enhance the quality of the output alignments compared to DIALIGN 2.2 and DIALIGN-T. For pairwise alignment, DIALIGN-TX uses a fragment-chaining algorithm that favours chains of low-scoring local alignments over isolated high-scoring fragments. For multiple alignment, DIALIGN-TX uses an improved greedy procedure that is less sensitive to spurious local sequence similarities.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::comparing, works-with-format::TODO, Obsługa formatu: Czysty tekst, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z dialign-tx

• dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-15)

  Segment-based multiple sequence alignment (data files)

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie dialign-tx

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.0.2-15	104,2 KiB	275,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.0.2-15	85,5 KiB	223,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0.2-15+b1	92,6 KiB	212,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0.2-15	75,1 KiB	198,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0.2-15	66,8 KiB	142,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.0.2-15	95,7 KiB	211,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0.2-15	79,5 KiB	210,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.0.2-15	151,4 KiB	447,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.0.2-15	66,0 KiB	194,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0.2-15	99,9 KiB	278,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.0.2-15	93,3 KiB	275,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0.2-15	93,0 KiB	275,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0.2-15	106,1 KiB	187,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0.2-15	73,6 KiB	202,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.0.2-15	91,8 KiB	210,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.0.2-15	84,4 KiB	1 044,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.0.2-15	82,1 KiB	206,0 KiB	[lista plików]