Paquet : sibelia (3.0.7+dfsg-3)

[ Paquet source : sibelia  ]

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Autres paquets associés à sibelia

• dep: lagan

  alignement global de séquences génomiques par paire, hautement paramétrable

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [non amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  fast suffix array construction

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: sibelia-examples

  comparative genomics tool (example data)

Télécharger sibelia

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	309,7 ko	1 176,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	278,3 ko	1 120,0 ko	[liste des fichiers]
armel	283,4 ko	1 139,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	289,5 ko	955,0 ko	[liste des fichiers]
i386	312,3 ko	1 151,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	278,1 ko	1 250,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	276,8 ko	1 261,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	305,1 ko	1 228,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	275,7 ko	1 128,0 ko	[liste des fichiers]