[ Source: cufflinks ]
Paketti: cufflinks (2.2.1+dfsg.1-8 ja muut) [non-free]
Links for cufflinks
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti cufflinks:
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1-8.dsc]
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1.orig.tar.gz]
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1-8.debian.tar.xz]
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Alexandre Mestiashvili (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
- Charles Plessy (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [cufflinks.cbcb.umd.edu]
Samankaltaisia paketteja:
Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq
Cufflinks assembles transcripts, estimates their abundances, and tests for differential expression and regulation in RNA-Seq samples. It accepts aligned RNA-Seq reads and assembles the alignments into a parsimonious set of transcripts. Cufflinks then estimates the relative abundances of these transcripts based on how many reads support each one.
Muut pakettiin cufflinks liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0)
- serialization library for C++
-
- dep: libboost-thread1.74.0 (>= 1.74.0)
- portable C++ multi-threading
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [amd64, armel, armhf]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 4.1) [s390x]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
-
- rec: gffread
- GFF/GTF format conversions, region filtering, FASTA sequence extraction
-
- enh: tophat
- Paketti ei saatavilla
Imuroi cufflinks
Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|---|
amd64 | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,500.5 kt | 10,384.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,390.1 kt | 9,869.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armel | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,211.9 kt | 9,133.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,114.3 kt | 6,213.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,522.5 kt | 10,603.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,561.7 kt | 15,202.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mipsel | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,500.6 kt | 13,369.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,549.2 kt | 13,797.0 kt | [tiedostoluettelo] |
s390x | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,314.2 kt | 10,901.0 kt | [tiedostoluettelo] |