Paket: gromacs (2024.5-1 und andere)

[ Quellcode: gromacs  ]

Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains variants both for execution on a single machine, and using the MPI interface across multiple machines.

Markierungen: Feld: Biologie, Strukturelle Biologie, field::chemistry, implemented-in::c, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, interface::graphical, interface::x11, Rolle: Programm, GUI-Baukasten: X-Bibliothek, X-Window-System: Anwendung

Andere Pakete mit Bezug zu gromacs

• dep: gromacs-data (= 2020.5-4) [alpha]

  Daten und Dokumentation für GROMACS, einen Simulator für Moleküldynamik

  dep: gromacs-data (= 2021.4-2) [hppa, m68k, sh4, x32]

  dep: gromacs-data (= 2023.1-2) [ia64]

  dep: gromacs-data (= 2024.5-1) [nicht alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.7) [hppa, m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht hppa, ia64, m68k, sh4]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgromacs5 (>= 2020.5) [alpha]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs6 (>= 2021.4) [hppa, m68k, sh4, x32]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs8 (>= 2023.1) [ia64]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs9 (>= 2024.5) [nicht alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.5) [ia64]

  Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [nicht alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nicht alpha]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: libx11-6 [alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  Clientseitige X11-Bibliothek

• dep: sse4.2-support [amd64, x32]

  CPU feature checking - require SSE4.2

• rec: cpp

  GNU-C-Präprozessor (cpp)

• rec: mpi-default-bin [nicht alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  Standard-MPI-Laufzeitdateien (Metapaket)

• sug: pymol

  Grafiksystem für Moleküle

gromacs herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	2020.5-4	146,5 kB	561,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	2024.5-1	62,8 kB	453,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2024.5-1	59,5 kB	589,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	2021.4-2	148,0 kB	512,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2023.1-2	65,7 kB	552,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	2021.4-2	134,9 kB	554,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2024.5-1	61,4 kB	601,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	2024.5-1	63,1 kB	589,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2024.5-1	61,7 kB	589,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2024.5-1	62,2 kB	397,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	2024.5-1	57,5 kB	413,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	2021.4-2	158,4 kB	484,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	2024.5-1	58,5 kB	4.181,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	2021.4-2	140,4 kB	514,0 kB	[Liste der Dateien]