Пакет: gromacs (2025.1-1 и другие)

[ Источник: gromacs  ]

Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains variants both for execution on a single machine, and using the MPI interface across multiple machines.

Теги: Область: Биология, Структурная биология, field::chemistry, implemented-in::c, Пользовательский интерфейс: Командная строка, interface::graphical, interface::x11, Роль: Программа, Инструментарий интерфейса: X-библиотека, X Window System: Приложение

Другие пакеты, относящиеся к gromacs

• dep: gromacs-data (= 2020.5-4) [alpha]

  GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

  dep: gromacs-data (= 2021.4-2) [hppa, m68k, sh4, x32]

  dep: gromacs-data (= 2023.1-2) [ia64]

  dep: gromacs-data (= 2025.1-1) [не alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, hppa, ia64, loong64, m68k, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [hppa, m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не hppa, ia64, m68k, sh4]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgromacs10 (>= 2025.1) [не alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs5 (>= 2020.5) [alpha]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs6 (>= 2021.4) [hppa, m68k, sh4, x32]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs8 (>= 2023.1) [ia64]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.5) [ia64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.7) [не alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 11) [не alpha]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• dep: libx11-6 [alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  библиотека X11 для клиентской стороны

• dep: sse4.2-support [amd64, x32]

  CPU feature checking - require SSE4.2

• rec: cpp

  препроцессор GNU C (cpp)

• rec: mpi-default-bin [не alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• sug: pymol

  Molecular Graphics System

Загрузка gromacs

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	2020.5-4	146,5 Кб	561,0 Кб	[список файлов]
amd64	2025.1-1	59,2 Кб	461,0 Кб	[список файлов]
arm64	2025.1-1	60,2 Кб	589,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	2021.4-2	148,0 Кб	512,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	2023.1-2	65,7 Кб	552,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	2025.1-1	59,1 Кб	589,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	2021.4-2	134,9 Кб	554,0 Кб	[список файлов]
mips64el	2025.1-1	59,9 Кб	601,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	2025.1-1	62,9 Кб	589,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	2025.1-1	62,0 Кб	589,0 Кб	[список файлов]
riscv64	2025.1-1	62,9 Кб	397,0 Кб	[список файлов]
s390x	2025.1-1	57,9 Кб	413,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	2021.4-2	158,4 Кб	484,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	2025.1-1	59,2 Кб	4 181,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	2021.4-2	140,4 Кб	514,0 Кб	[список файлов]