Paket: gromacs (2022.5-2)

[ Quellcode: gromacs  ]

Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains variants both for execution on a single machine, and using the MPI interface across multiple machines.

Markierungen: Feld: Biologie, Strukturelle Biologie, field::chemistry, implemented-in::c, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, interface::graphical, interface::x11, Rolle: Programm, GUI-Baukasten: X-Bibliothek, X-Window-System: Anwendung

Andere Pakete mit Bezug zu gromacs

• dep: gromacs-data (= 2022.5-2)

  Daten und Dokumentation für GROMACS, einen Simulator für Moleküldynamik

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgromacs7 (>= 2022.5)

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

  Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libx11-6

  Clientseitige X11-Bibliothek

• dep: sse4.2-support [amd64]

  CPU feature checking - require SSE4.2

• rec: cpp

  GNU-C-Präprozessor (cpp)

• rec: mpi-default-bin

  Standard-MPI-Laufzeitdateien (Metapaket)

• sug: pymol

  Grafiksystem für Moleküle

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	137,2 kB	727,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	130,8 kB	857,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	137,1 kB	885,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	142,7 kB	857,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	121,9 kB	697,0 kB	[Liste der Dateien]