Пакет: gromacs (2025.1-1 и други)

[ Източник: gromacs  ]

Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains variants both for execution on a single machine, and using the MPI interface across multiple machines.

Етикети: Field: Biology, Structural Biology, field::chemistry, implemented-in::c, User Interface: Command Line, interface::graphical, interface::x11, Role: Program, Interface Toolkit: X library, X Window System: Application

Други пакети, свързани с gromacs

• dep: gromacs-data (= 2020.5-4) [alpha]

  GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

  dep: gromacs-data (= 2021.4-2) [hppa, m68k, sh4, x32]

  dep: gromacs-data (= 2023.1-2) [ia64]

  dep: gromacs-data (= 2025.1-1) [не alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, hppa, ia64, loong64, m68k, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [hppa, m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не hppa, ia64, m68k, sh4]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libgromacs10 (>= 2025.1) [не alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs5 (>= 2020.5) [alpha]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs6 (>= 2021.4) [hppa, m68k, sh4, x32]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs8 (>= 2023.1) [ia64]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.5) [ia64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.7) [не alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 11) [не alpha]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: libx11-6 [alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  X11 client-side library

• dep: sse4.2-support [amd64, x32]

  CPU feature checking - require SSE4.2

• rec: cpp

  GNU C preprocessor (cpp)

• rec: mpi-default-bin [не alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• sug: pymol

  Molecular Graphics System

Изтегляне на gromacs

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	2020.5-4	146,5 кБ	561,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	2025.1-1	59,2 кБ	461,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2025.1-1	60,2 кБ	589,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	2021.4-2	148,0 кБ	512,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	2023.1-2	65,7 кБ	552,0 кБ	[списък на файловете]
loong64 (неофициална архитектура)	2025.1-1	59,1 кБ	589,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	2021.4-2	134,9 кБ	554,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2025.1-1	59,9 кБ	601,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	2025.1-1	62,9 кБ	589,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	2025.1-1	62,0 кБ	589,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	2025.1-1	62,9 кБ	397,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	2025.1-1	57,9 кБ	413,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	2021.4-2	158,4 кБ	484,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	2025.1-1	59,2 кБ	4 181,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	2021.4-2	140,4 кБ	514,0 кБ	[списък на файловете]