Balík: gromacs (2025.0-2 a iné)

[ Zdroj: gromacs  ]

Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains variants both for execution on a single machine, and using the MPI interface across multiple machines.

Značky: Pole: Biológia, Structural Biology, field::chemistry, implemented-in::c, User Interface: Príkazový riadok, interface::graphical, interface::x11, Role: Program, Sada nástrojov používateľského rozhrania: X library, X Window System: Aplikácia

Ostatné balíky súvisiace s balíkom gromacs

• dep: gromacs-data (= 2020.5-4) [alpha]

  GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

  dep: gromacs-data (= 2021.4-2) [hppa, m68k, sh4, x32]

  dep: gromacs-data (= 2023.1-2) [ia64]

  dep: gromacs-data (= 2025.0-2) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.7) [hppa, m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie hppa, ia64, m68k, sh4]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgromacs10 (>= 2025.0) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs5 (>= 2020.5) [alpha]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs6 (>= 2021.4) [hppa, m68k, sh4, x32]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs8 (>= 2023.1) [ia64]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.5) [ia64]

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nie alpha]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• dep: libx11-6 [alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  X11 client-side library

• dep: sse4.2-support [amd64, x32]

  CPU feature checking - require SSE4.2

• rec: cpp

  preprocesor GNU C (cpp)

• rec: mpi-default-bin [nie alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  štandardné dynamické programy MPI - metabalík

• sug: pymol

  systém na vykresľovanie molekúl

Stiahnuť gromacs

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	2020.5-4	146.5 kB	561.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	2025.0-2	59.4 kB	461.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	2025.0-2	60.1 kB	589.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	2021.4-2	148.0 kB	512.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	2023.1-2	65.7 kB	552.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	2021.4-2	134.9 kB	554.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	2025.0-2	60.0 kB	601.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	2025.0-2	63.8 kB	589.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	2025.0-2	62.0 kB	589.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	2025.0-2	62.7 kB	397.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	2025.0-2	57.3 kB	413.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	2021.4-2	158.4 kB	484.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	2025.0-2	59.3 kB	4,181.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	2021.4-2	140.4 kB	514.0 kB	[zoznam súborov]