Pakiet: gromacs (2024.4-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: gromacs  ]

Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains variants both for execution on a single machine, and using the MPI interface across multiple machines.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Biologia strukturalna, field::chemistry, implemented-in::c, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, interface::graphical, interface::x11, Rola: Program, Pakiet narzędziowy interfejsu: Biblioteka X, X Window System: Aplikacja

Inne pakiety związane z gromacs

• dep: gromacs-data (= 2020.5-4) [alpha]

  GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

  dep: gromacs-data (= 2021.4-2) [hppa, m68k, sh4, x32]

  dep: gromacs-data (= 2023.1-2) [ia64]

  dep: gromacs-data (= 2024.4-1) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.7) [hppa, m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie hppa, ia64, m68k, sh4]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgromacs5 (>= 2020.5) [alpha]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs6 (>= 2021.4) [hppa, m68k, sh4, x32]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs8 (>= 2023.1) [ia64]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs9 (>= 2024.4) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.5) [ia64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nie alpha]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: libx11-6 [alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  Biblioteka X11 po stronie klienta

• dep: sse4.2-support [amd64, x32]

  CPU feature checking - require SSE4.2

• rec: cpp

  Preprocesor GNU C

• rec: mpi-default-bin [nie alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• sug: pymol

  Molekularny system graficzny

Pobieranie gromacs

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2020.5-4	146,5 KiB	561,0 KiB	[lista plików]
amd64	2024.4-1+b1	62,7 KiB	454,0 KiB	[lista plików]
arm64	2024.4-1+b1	59,9 KiB	590,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2021.4-2	148,0 KiB	512,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2023.1-2	65,7 KiB	552,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2021.4-2	134,9 KiB	554,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2024.4-1+b1	61,6 KiB	602,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2024.4-1+b1	63,4 KiB	590,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2024.4-1+b1	62,0 KiB	590,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2024.4-1+b1	62,4 KiB	398,0 KiB	[lista plików]
s390x	2024.4-1+b1	57,8 KiB	414,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2021.4-2	158,4 KiB	484,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2024.4-1+b1	58,9 KiB	4 182,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2021.4-2	140,4 KiB	514,0 KiB	[lista plików]