Пакунок: gromacs (2024.4-1 and others)

[ Source: gromacs  ]

Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains variants both for execution on a single machine, and using the MPI interface across multiple machines.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, field::chemistry, implemented-in::c, User Interface: Command Line, interface::graphical, interface::x11, Role: Program, Interface Toolkit: X library, X Window System: Application

Інші пакунки пов'язані з gromacs

• dep: gromacs-data (= 2020.5-4) [alpha]

  GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

  dep: gromacs-data (= 2021.4-2) [hppa, m68k, sh4, x32]

  dep: gromacs-data (= 2023.1-2) [ia64]

  dep: gromacs-data (= 2024.4-1) [not alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.7) [hppa, m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not hppa, ia64, m68k, sh4]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgromacs5 (>= 2020.5) [alpha]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs6 (>= 2021.4) [hppa, m68k, sh4, x32]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs8 (>= 2023.1) [ia64]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libgromacs9 (>= 2024.4) [not alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.5) [ia64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [not alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 11) [not alpha]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: libx11-6 [alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  Клієнтська бібліотека X11

• dep: sse4.2-support [amd64, x32]

  CPU feature checking - require SSE4.2

• rec: cpp

  Препроцесор GNU C (cpp)

• rec: mpi-default-bin [not alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• sug: pymol

  Графічна система відтворення молекул

Завантажити gromacs

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	2020.5-4	146.5 kB	561.0 kB	[список файлів]
amd64	2024.4-1+b1	62.7 kB	454.0 kB	[список файлів]
arm64	2024.4-1+b1	59.9 kB	590.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	2021.4-2	148.0 kB	512.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	2023.1-2	65.7 kB	552.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	2021.4-2	134.9 kB	554.0 kB	[список файлів]
mips64el	2024.4-1+b1	61.6 kB	602.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	2024.4-1+b1	63.4 kB	590.0 kB	[список файлів]
ppc64el	2024.4-1+b1	62.0 kB	590.0 kB	[список файлів]
riscv64	2024.4-1+b1	62.4 kB	398.0 kB	[список файлів]
s390x	2024.4-1+b1	57.8 kB	414.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	2021.4-2	158.4 kB	484.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	2024.4-1+b1	58.9 kB	4,182.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	2021.4-2	140.4 kB	514.0 kB	[список файлів]