Package: voronota (1.22.3149-2 and others)

[ Source: voronota  ]

Voronoi-diagrambaseret værktøj til at finde atomkontakter

Analysen af makromolekylære strukturer kræver ofte en omfattende definition af atomare naboskaber. Sådan en definition kan baseres på Voronoidiagrammet med bolde, hvor hver bold repræsenterer et atom med en van der Waals-radius. Voronota er et programværktøj til at finde alle knuderne for Voronoidiagrammet. Sådanne knuder svarer til centrene for den tomme tangentsfære defineret af firdoblinger af bolde. Voronota er specielt egnet til behandling af tredimensionelle strukturer med biologiske makromolekyler såsom proteiner og RNA.

Siden version 1.2 bruger Voronota også Voronoiknuder til at konstruere inter-atom kontaktoverflader og solvente tilgængelige overflader. Voronota tilbyder værktøjer til at forespørge kontakter, oprette kontaktgrafik, sammenligne kontakter og evaluere kvaliteten på proteinstrukturelle modeller via kontakter.

Other Packages Related to voronota

• dep: bsdextrautils

  Ekstra redskaber fra 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [not arm64, armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64el, s390x]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC støttebibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 11) [not arm64, riscv64]

  GNU Standard C++ bibliotek v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid

Download voronota

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.22.3149-2	1,971.4 kB	12,093.0 kB	[list of files]
amd64	1.22.3149-2	2,008.7 kB	11,396.0 kB	[list of files]
arm64	1.22.3149-2+b1	1,938.0 kB	11,321.0 kB	[list of files]
armel	1.22.3149-2	1,821.0 kB	10,873.0 kB	[list of files]
armhf	1.22.3149-2	1,845.7 kB	9,977.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.22.3149-2	1,946.6 kB	11,094.0 kB	[list of files]
i386	1.22.3149-2	2,104.1 kB	11,667.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.22.3149-2	2,211.0 kB	15,074.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.22.3149-2	1,800.6 kB	11,207.0 kB	[list of files]
mips64el	1.22.3149-2	1,881.7 kB	12,471.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.22.3149-2	2,001.4 kB	12,282.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.22.3149-2	2,016.5 kB	11,896.0 kB	[list of files]
riscv64	1.22.3149-2+b1	1,986.0 kB	10,509.0 kB	[list of files]
s390x	1.22.3149-2	1,875.4 kB	11,436.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.22.3149-2	2,024.1 kB	10,807.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.22.3149-2	1,790.5 kB	12,033.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.22.3149-2	1,981.4 kB	11,063.0 kB	[list of files]