Pakiet: voronota (1.22.3149-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: voronota  ]

Voronoi diagram-based tool to find atom contacts

The analysis of macromolecular structures often requires a comprehensive definition of atomic neighborhoods. Such a definition can be based on the Voronoi diagram of balls, where each ball represents an atom of some van der Waals radius. Voronota is a software tool for finding all the vertices of the Voronoi diagram of balls. Such vertices correspond to the centers of the empty tangent spheres defined by quadruples of balls. Voronota is especially suitable for processing three-dimensional structures of biological macromolecules such as proteins and RNA.

Since version 1.2 Voronota also uses the Voronoi vertices to construct inter-atom contact surfaces and solvent accessible surfaces. Voronota provides tools to query contacts, generate contacts graphics, compare contacts and evaluate quality of protein structural models using contacts.

Inne pakiety związane z voronota

• dep: bsdextrautils

  Dodatkowe narzędzia z 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [nie arm64, armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64el, s390x]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nie arm64, riscv64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

Pobieranie voronota

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.22.3149-2	1 971,4 KiB	12 093,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.22.3149-2	2 008,7 KiB	11 396,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.22.3149-2+b1	1 938,0 KiB	11 321,0 KiB	[lista plików]
armel	1.22.3149-2	1 821,0 KiB	10 873,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.22.3149-2	1 845,7 KiB	9 977,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.22.3149-2	1 946,6 KiB	11 094,0 KiB	[lista plików]
i386	1.22.3149-2	2 104,1 KiB	11 667,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.22.3149-2	2 211,0 KiB	15 074,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.22.3149-2	1 800,6 KiB	11 207,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.22.3149-2	1 881,7 KiB	12 471,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.22.3149-2	2 001,4 KiB	12 282,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.22.3149-2	2 016,5 KiB	11 896,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.22.3149-2+b1	1 986,0 KiB	10 509,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.22.3149-2	1 875,4 KiB	11 436,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.22.3149-2	2 024,1 KiB	10 807,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.22.3149-2	1 790,5 KiB	12 033,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.22.3149-2	1 981,4 KiB	11 063,0 KiB	[lista plików]