套件：voronota（1.22.3149-2 以及其他的）

[ 原始碼： voronota  ]

Voronoi diagram-based tool to find atom contacts

The analysis of macromolecular structures often requires a comprehensive definition of atomic neighborhoods. Such a definition can be based on the Voronoi diagram of balls, where each ball represents an atom of some van der Waals radius. Voronota is a software tool for finding all the vertices of the Voronoi diagram of balls. Such vertices correspond to the centers of the empty tangent spheres defined by quadruples of balls. Voronota is especially suitable for processing three-dimensional structures of biological macromolecules such as proteins and RNA.

Since version 1.2 Voronota also uses the Voronoi vertices to construct inter-atom contact surfaces and solvent accessible surfaces. Voronota provides tools to query contacts, generate contacts graphics, compare contacts and evaluate quality of protein structural models using contacts.

其他與 voronota 有關的套件

• dep: bsdextrautils

  extra utilities from 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [除 arm64, armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64el, s390x]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支援函式庫

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支援函式庫

• dep: libstdc++6 (>= 11) [除 arm64, riscv64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

下載 voronota

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	1.22.3149-2	1，971。4 kB	12，093。0 kB	[檔案列表]
amd64	1.22.3149-2	2，008。7 kB	11，396。0 kB	[檔案列表]
arm64	1.22.3149-2+b1	1，938。0 kB	11，321。0 kB	[檔案列表]
armel	1.22.3149-2	1，821。0 kB	10，873。0 kB	[檔案列表]
armhf	1.22.3149-2	1，845。7 kB	9，977。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	1.22.3149-2	1，946。6 kB	11，094。0 kB	[檔案列表]
i386	1.22.3149-2	2，104。1 kB	11，667。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	1.22.3149-2	2，211。0 kB	15，074。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	1.22.3149-2	1，800。6 kB	11，207。0 kB	[檔案列表]
mips64el	1.22.3149-2	1，881。7 kB	12，471。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	1.22.3149-2	2，001。4 kB	12，282。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	1.22.3149-2	2，016。5 kB	11，896。0 kB	[檔案列表]
riscv64	1.22.3149-2+b1	1，986。0 kB	10，509。0 kB	[檔案列表]
s390x	1.22.3149-2	1，875。4 kB	11，436。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	1.22.3149-2	2，024。1 kB	10，807。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	1.22.3149-2	1，790。5 kB	12，033。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	1.22.3149-2	1，981。4 kB	11，063。0 kB	[檔案列表]