all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  sid  ]
[ Source: sumatra  ]

Package: sumatra (1.0.36+ds-2 and others)

Links for sumatra

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package sumatra:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Hurtig og præcis sammenligning og sekvensklynger

Med udviklingen af den næste generation af sekventering skal effektive værktøjer håndterer millioner af sekvenser på en fornuftig tid. Sumatra er et program udviklet af LECA. Sumatra forsøger at sammenligne sekvenser på en måde som er hurtig og præcis på samme tid. Dette værktøj er blevet udviklet som en tilpasning til den type af data som oprettes af DNA-metastregkodere, dvs. fuldt ud sekventeret, korte markører. Sumatra beregner de parvis sammenligningsbedømmelser fra et datasæt eller mellem to datasæt, med mulighed for at angive en lighedstærskel hvorefter sekvenspar som har en lavere lighed ikke rapporteres. Uddata kan gå igennem en klassifikationsproces med programmer såsom MCL eller MOTHUR.

Other Packages Related to sumatra

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download sumatra

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
alpha (unofficial port) 1.0.36+ds-2 78.7 kB176.0 kB [list of files]
amd64 1.0.36+ds-2 78.5 kB136.0 kB [list of files]
arm64 1.0.36+ds-2 77.8 kB175.0 kB [list of files]
armel 1.0.36+ds-2 78.9 kB175.0 kB [list of files]
armhf 1.0.36+ds-2 78.0 kB175.0 kB [list of files]
hppa (unofficial port) 1.0.36+ds-2 79.7 kB132.0 kB [list of files]
i386 1.0.36+ds-2 78.6 kB135.0 kB [list of files]
ia64 (unofficial port) 1.0.36+ds-2 81.2 kB143.0 kB [list of files]
m68k (unofficial port) 1.0.36+ds-2 77.6 kB135.0 kB [list of files]
mips64el 1.0.36+ds-2 78.1 kB176.0 kB [list of files]
ppc64 (unofficial port) 1.0.36+ds-2 79.1 kB240.0 kB [list of files]
ppc64el 1.0.36+ds-2 79.0 kB176.0 kB [list of files]
riscv64 1.0.36+ds-2+b1 78.1 kB129.0 kB [list of files]
s390x 1.0.36+ds-2 78.1 kB131.0 kB [list of files]
sh4 (unofficial port) 1.0.36+ds-2 79.0 kB175.0 kB [list of files]
sparc64 (unofficial port) 1.0.36+ds-2 77.7 kB1,136.0 kB [list of files]
x32 (unofficial port) 1.0.36+ds-2 78.6 kB135.0 kB [list of files]