Pakiet: sumatra (1.0.36+ds-2 i inne)

Odnośniki dla sumatra

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego sumatra:

Opiekunowie:

Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
Tim Booth (Strona QA)
Andreas Tille (Strona QA)
Pierre Gruet (Strona QA)

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [metabarcoding.org]

Podobne pakiety:

fast and exact comparison and clustering of sequences

With the development of next-generation sequencing, efficient tools are needed to handle millions of sequences in reasonable amounts of time. Sumatra is a program developed by the LECA. Sumatra aims to compare sequences in a way that is fast and exact at the same time. This tool has been developed to be adapted to the type of data generated by DNA metabarcoding, i.e. entirely sequenced, short markers. Sumatra computes the pairwise alignment scores from one dataset or between two datasets, with the possibility to specify a similarity threshold under which pairs of sequences that have a lower similarity are not reported. The output can then go through a classification process with programs such as MCL or MOTHUR.

Inne pakiety związane z sumatra

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.33) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.7) [nie alpha, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libsuma1 (>= 1.0.35)

shared library for sumatra and sumaclust
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie sumatra

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	78,7 KiB	176,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.0.36+ds-2	78,5 KiB	136,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0.36+ds-2	77,8 KiB	175,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0.36+ds-2	78,9 KiB	175,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0.36+ds-2	78,0 KiB	175,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	79,7 KiB	132,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0.36+ds-2	78,6 KiB	135,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	81,2 KiB	143,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	77,6 KiB	135,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0.36+ds-2	78,1 KiB	176,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	79,1 KiB	240,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0.36+ds-2	79,0 KiB	176,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0.36+ds-2+b1	78,1 KiB	129,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0.36+ds-2	78,1 KiB	131,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	79,0 KiB	175,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	77,7 KiB	1 136,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.0.36+ds-2	78,6 KiB	135,0 KiB	[lista plików]