Balík: sumatra (1.0.36+ds-2 a iné)

Odkazy pre sumatra

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík sumatra:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [metabarcoding.org]

Podobné balíky:

fast and exact comparison and clustering of sequences

With the development of next-generation sequencing, efficient tools are needed to handle millions of sequences in reasonable amounts of time. Sumatra is a program developed by the LECA. Sumatra aims to compare sequences in a way that is fast and exact at the same time. This tool has been developed to be adapted to the type of data generated by DNA metabarcoding, i.e. entirely sequenced, short markers. Sumatra computes the pairwise alignment scores from one dataset or between two datasets, with the possibility to specify a similarity threshold under which pairs of sequences that have a lower similarity are not reported. The output can then go through a classification process with programs such as MCL or MOTHUR.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom sumatra

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.33) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.7) [nie alpha, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libsuma1 (>= 1.0.35)

shared library for sumatra and sumaclust
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť sumatra

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.0.36+ds-2	78.7 kB	176.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.0.36+ds-2	78.5 kB	136.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.0.36+ds-2	77.8 kB	175.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.0.36+ds-2	78.9 kB	175.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.0.36+ds-2	78.0 kB	175.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.0.36+ds-2	79.7 kB	132.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.0.36+ds-2	78.6 kB	135.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.0.36+ds-2	81.2 kB	143.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.0.36+ds-2	77.6 kB	135.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.0.36+ds-2	78.1 kB	176.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.0.36+ds-2	79.1 kB	240.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.0.36+ds-2	79.0 kB	176.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.0.36+ds-2+b1	78.1 kB	129.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.0.36+ds-2	78.1 kB	131.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.0.36+ds-2	79.0 kB	175.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.0.36+ds-2	77.7 kB	1,136.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.0.36+ds-2	78.6 kB	135.0 kB	[zoznam súborov]