[ Source: sumatra ]
Package: sumatra (1.0.36+ds-2)
Links for sumatra
Debian Resources:
Download Source Package sumatra:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Tim Booth (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Pierre Gruet (QA Page)
External Resources:
- Homepage [metabarcoding.org]
Similar packages:
Hurtig og præcis sammenligning og sekvensklynger
Med udviklingen af den næste generation af sekventering skal effektive værktøjer håndterer millioner af sekvenser på en fornuftig tid. Sumatra er et program udviklet af LECA. Sumatra forsøger at sammenligne sekvenser på en måde som er hurtig og præcis på samme tid. Dette værktøj er blevet udviklet som en tilpasning til den type af data som oprettes af DNA-metastregkodere, dvs. fuldt ud sekventeret, korte markører. Sumatra beregner de parvis sammenligningsbedømmelser fra et datasæt eller mellem to datasæt, med mulighed for at angive en lighedstærskel hvorefter sekvenspar som har en lavere lighed ikke rapporteres. Uddata kan gå igennem en klassifikationsproces med programmer såsom MCL eller MOTHUR.
Other Packages Related to sumatra
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.7) [not arm64, ppc64el]
-
- dep: libsuma1 (>= 1.0.35)
- Delt bibliotek for sumatra og sumaclust
Download sumatra
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 78.5 kB | 136.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 77.8 kB | 175.0 kB | [list of files] |
| armel | 78.9 kB | 175.0 kB | [list of files] |
| armhf | 78.0 kB | 175.0 kB | [list of files] |
| i386 | 78.6 kB | 135.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 78.1 kB | 176.0 kB | [list of files] |
| mipsel | 78.3 kB | 176.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 79.0 kB | 176.0 kB | [list of files] |
| s390x | 78.1 kB | 131.0 kB | [list of files] |