Пакунок: probcons (1.12-14 and others)

[ Source: probcons  ]

PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

Tool for generating multiple alignments of protein sequences. Using a combination of probabilistic modeling and consistency-based alignment techniques, PROBCONS has achieved the highest accuracies of all alignment methods to date. On the BAliBASE benchmark alignment database, alignments produced by PROBCONS show statistically significant improvement over current programs, containing an average of 7% more correctly aligned columns than those of T-Coffee, 11% more correctly aligned columns than those of CLUSTAL W, and 14% more correctly aligned columns than those of DIALIGN.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Інші пакунки пов'язані з probcons

• dep: libc6 (>= 2.27) [not alpha, arm64, ia64, loong64, riscv64, sh4]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [loong64]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [not arm64, armel, armhf, loong64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• sug: probcons-extra

  Extra programs from the probcons package

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Завантажити probcons

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	1.12-14	142.6 kB	418.0 kB	[список файлів]
amd64	1.12-14	116.4 kB	377.0 kB	[список файлів]
arm64	1.12-14+b1	121.3 kB	415.0 kB	[список файлів]
armel	1.12-14	105.1 kB	347.0 kB	[список файлів]
armhf	1.12-14	103.2 kB	255.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	1.12-14	128.9 kB	366.0 kB	[список файлів]
i386	1.12-14	102.4 kB	367.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	1.12-14	191.0 kB	741.0 kB	[список файлів]
loong64 (unofficial port)	1.12-14	115.1 kB	352.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	1.12-14	96.7 kB	367.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.12-14	129.1 kB	410.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	1.12-14	134.5 kB	481.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.12-14	136.2 kB	417.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.12-14+b1	131.1 kB	303.0 kB	[список файлів]
s390x	1.12-14	99.7 kB	376.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	1.12-14	131.4 kB	312.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	1.12-14	117.5 kB	374.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	1.12-14	122.0 kB	371.0 kB	[список файлів]