パッケージ: probcons (1.12-14 など)

[ ソース: probcons  ]

確率的で整合性に基づく多重配列アライメント

タンパク質配列の多重アライメントの生成用ツールです。確率モデリングと整合性 に基づくアライメント技術を組み合わせて、PROBCONS は今までの全アライメント技 術のうちで最高の正確さを達成しました。BAliBASE ベンチマークアラインメント データベースによると、PROBCONS が生成したアライメントは現存のプログラムと比 べて統計的に顕著に改善されています。T-Coffee と比べて平均 7%、CLUSTAL W と 比べて 11%、DIALIGN に比べて 14%、より正しく配置された列を生成します。

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::comparing, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の probcons 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.27) [alpha, ia64, riscv64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [armel, armhf, riscv64 以外]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• sug: probcons-extra

  probcons パッケージ由来の特別プログラム

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

probcons のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.12-14	142.6 kB	418.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.12-14	116.4 kB	377.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.12-14	109.1 kB	328.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.12-14	105.1 kB	347.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.12-14	103.2 kB	255.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.12-14	128.9 kB	366.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.12-14	102.4 kB	367.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.12-14	191.0 kB	741.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.12-14	96.7 kB	367.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.12-14	129.1 kB	410.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.12-14	134.5 kB	481.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.12-14	136.2 kB	417.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.12-14+b1	131.1 kB	303.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.12-14	99.7 kB	376.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.12-14	131.4 kB	312.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.12-14	117.5 kB	374.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.12-14	122.0 kB	371.0 kB	[ファイル一覧]