Пакет: probcons (1.12-14 и други)

[ Източник: probcons  ]

PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

Tool for generating multiple alignments of protein sequences. Using a combination of probabilistic modeling and consistency-based alignment techniques, PROBCONS has achieved the highest accuracies of all alignment methods to date. On the BAliBASE benchmark alignment database, alignments produced by PROBCONS show statistically significant improvement over current programs, containing an average of 7% more correctly aligned columns than those of T-Coffee, 11% more correctly aligned columns than those of CLUSTAL W, and 14% more correctly aligned columns than those of DIALIGN.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Други пакети, свързани с probcons

• dep: libc6 (>= 2.27) [не alpha, ia64, riscv64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [не armel, armhf, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• sug: probcons-extra

  Extra programs from the probcons package

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Изтегляне на probcons

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.12-14	142,6 кБ	418,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.12-14	116,4 кБ	377,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.12-14	109,1 кБ	328,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.12-14	105,1 кБ	347,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.12-14	103,2 кБ	255,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.12-14	128,9 кБ	366,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.12-14	102,4 кБ	367,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.12-14	191,0 кБ	741,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.12-14	96,7 кБ	367,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.12-14	129,1 кБ	410,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.12-14	134,5 кБ	481,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.12-14	136,2 кБ	417,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.12-14+b1	131,1 кБ	303,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.12-14	99,7 кБ	376,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.12-14	131,4 кБ	312,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.12-14	117,5 кБ	374,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.12-14	122,0 кБ	371,0 кБ	[списък на файловете]