Пакет: probcons (1.12-14 и другие)

[ Источник: probcons  ]

PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

Tool for generating multiple alignments of protein sequences. Using a combination of probabilistic modeling and consistency-based alignment techniques, PROBCONS has achieved the highest accuracies of all alignment methods to date. On the BAliBASE benchmark alignment database, alignments produced by PROBCONS show statistically significant improvement over current programs, containing an average of 7% more correctly aligned columns than those of T-Coffee, 11% more correctly aligned columns than those of CLUSTAL W, and 14% more correctly aligned columns than those of DIALIGN.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c++, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::comparing, works-with-format::plaintext, Работает с: Требуется дополнительный тег

Другие пакеты, относящиеся к probcons

• dep: libc6 (>= 2.27) [не alpha, arm64, ia64, loong64, riscv64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [loong64]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [не arm64, armel, armhf, loong64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• sug: probcons-extra

  Extra programs from the probcons package

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Загрузка probcons

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.12-14	142,6 Кб	418,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.12-14	116,4 Кб	377,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.12-14+b1	121,3 Кб	415,0 Кб	[список файлов]
armel	1.12-14	105,1 Кб	347,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.12-14	103,2 Кб	255,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.12-14	128,9 Кб	366,0 Кб	[список файлов]
i386	1.12-14	102,4 Кб	367,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.12-14	191,0 Кб	741,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	1.12-14	115,1 Кб	352,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.12-14	96,7 Кб	367,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.12-14	129,1 Кб	410,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.12-14	134,5 Кб	481,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.12-14	136,2 Кб	417,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.12-14+b1	131,1 Кб	303,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.12-14	99,7 Кб	376,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.12-14	131,4 Кб	312,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.12-14	117,5 Кб	374,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.12-14	122,0 Кб	371,0 Кб	[список файлов]