パッケージ: libfastahack0 (1.0.0+dfsg-11 など)

[ ソース: libfastahack  ]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This package contains the dynamic library.

タグ: 役割: 共有ライブラリ

その他の libfastahack0 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

libfastahack0 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	23.1 kB	83.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.0.0+dfsg-11+b2	25.8 kB	83.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.0.0+dfsg-11+b2	23.1 kB	87.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.0.0+dfsg-11+b2	23.6 kB	74.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.0.0+dfsg-11+b2	23.7 kB	58.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	26.8 kB	75.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.0.0+dfsg-11+b2	26.7 kB	78.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11	30.7 kB	117.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	25.2 kB	74.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.0.0+dfsg-11+b2	24.0 kB	90.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	25.5 kB	146.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.0.0+dfsg-11+b2	25.8 kB	87.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.0.0+dfsg-11+b2	23.9 kB	62.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.0.0+dfsg-11+b2	24.6 kB	74.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	27.2 kB	82.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	21.5 kB	1,051.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	25.1 kB	70.0 kB	[ファイル一覧]