Paket: libfastahack0 (1.0.0+dfsg-11 och andra)

[ Källkod: libfastahack  ]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This package contains the dynamic library.

Märken: Role: Shared Library

Andra paket besläktade med libfastahack0

• dep: libc6 (>= 2.38) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.33) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC stödbibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC stödbibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Hämta libfastahack0

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.0.0+dfsg-11	23,7 kbyte	82,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1.0.0+dfsg-11+b2	25,8 kbyte	83,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.0.0+dfsg-11+b2	23,1 kbyte	87,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.0.0+dfsg-11+b2	23,6 kbyte	74,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.0.0+dfsg-11+b2	23,7 kbyte	58,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	1.0.0+dfsg-11+b1	26,8 kbyte	75,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.0.0+dfsg-11+b2	26,7 kbyte	78,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1.0.0+dfsg-11	30,7 kbyte	117,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1.0.0+dfsg-11+b1	25,2 kbyte	74,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.0.0+dfsg-11+b2	24,0 kbyte	90,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	1.0.0+dfsg-11+b1	25,5 kbyte	146,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.0.0+dfsg-11+b2	25,8 kbyte	87,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.0.0+dfsg-11+b2	23,9 kbyte	62,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.0.0+dfsg-11+b2	24,6 kbyte	74,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1.0.0+dfsg-11+b1	27,2 kbyte	82,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	1.0.0+dfsg-11+b1	21,5 kbyte	1.051,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	1.0.0+dfsg-11+b1	25,1 kbyte	70,0 kbyte	[filförteckning]