Package: libfastahack0 (1.0.0+dfsg-7)

[ Source: libfastahack  ]

Bibliotek for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer - bibliotek

Fastahack er et lille program til indeksering og udtrækning af sekvenser og undersekvenser fra FASTA-filer. Det inkluderede Fasta.cpp-bibliotek tilbyder en FASTA-læser og et indeksprogram, som kan indlejres i programmer, som vil have nytte af direkte læsning af undersekvenser fra FASTA-filer. Biblioteket håndterer automatisk oprettelse af indeksfil og brug.

Funktioner:

 * FASTA-indeksoprettelse (.fai) for FASTA-filer
 * Sekvensudtrækning
 * Undersekvensudtrækning
 * Sekvensstatistik (i øjeblikket er kun entropi indeholdt)

Sekvens- og undersekvensudtrækning bruger fseek64 til at tilbyde hurtigst mulig udtrækning uden RAM-intensive operationer for filindlæsning. Dette gør fastahack til et nyttigt værktøj for bioinformatikere, som hurtigt skal udtrække mange undersekvenser fra en FASTA-referencesekvens.

Denne pakke indeholder det dynamiske bibliotek.

Tags: Role: Shared Library

Other Packages Related to libfastahack0

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download libfastahack0

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	25.0 kB	83.0 kB	[list of files]
arm64	23.1 kB	75.0 kB	[list of files]
armel	23.3 kB	69.0 kB	[list of files]
armhf	23.7 kB	57.0 kB	[list of files]
i386	27.4 kB	81.0 kB	[list of files]
mips64el	24.3 kB	82.0 kB	[list of files]
mipsel	25.0 kB	79.0 kB	[list of files]
ppc64el	26.3 kB	87.0 kB	[list of files]
s390x	22.8 kB	77.0 kB	[list of files]