Paketti: libfastahack0 (1.0.0+dfsg-11 ja muut)

[ Source: libfastahack  ]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This package contains the dynamic library.

Tagit: Role: Shared Library

Muut pakettiin libfastahack0 liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.38) [ei alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Imuroi libfastahack0

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-11+b1	23.1 kt	83.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.0.0+dfsg-11+b2	25.8 kt	83.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.0.0+dfsg-11+b2	23.1 kt	87.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.0.0+dfsg-11+b2	23.6 kt	74.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.0.0+dfsg-11+b2	23.7 kt	58.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-11+b1	26.8 kt	75.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.0.0+dfsg-11+b2	26.7 kt	78.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-11	30.7 kt	117.0 kt	[tiedostoluettelo]
loong64 (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-11+b1	23.4 kt	82.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-11+b1	25.2 kt	74.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.0.0+dfsg-11+b2	24.0 kt	90.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-11+b1	25.5 kt	146.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.0.0+dfsg-11+b2	25.8 kt	87.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.0.0+dfsg-11+b2	23.9 kt	62.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.0.0+dfsg-11+b2	24.6 kt	74.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-11+b1	27.2 kt	82.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-11+b1	21.5 kt	1,051.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-11+b1	25.1 kt	70.0 kt	[tiedostoluettelo]