Pakiet: libfastahack0 (1.0.0+dfsg-11 i inne)

[ Pakiet źródłowy: libfastahack  ]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This package contains the dynamic library.

Znaczniki: Rola: Biblioteka współdzielona

Inne pakiety związane z libfastahack0

• dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

Pobieranie libfastahack0

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	23,1 KiB	83,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.0.0+dfsg-11+b2	25,8 KiB	83,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0.0+dfsg-11+b2	23,1 KiB	87,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0.0+dfsg-11+b2	23,6 KiB	74,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0.0+dfsg-11+b2	23,7 KiB	58,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	26,8 KiB	75,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0.0+dfsg-11+b2	26,7 KiB	78,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11	30,7 KiB	117,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	25,2 KiB	74,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0.0+dfsg-11+b2	24,0 KiB	90,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	25,5 KiB	146,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0.0+dfsg-11+b2	25,8 KiB	87,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0.0+dfsg-11+b2	23,9 KiB	62,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0.0+dfsg-11+b2	24,6 KiB	74,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	27,2 KiB	82,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	21,5 KiB	1 051,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11+b1	25,1 KiB	70,0 KiB	[lista plików]