Package: libbifrost0 (1.3.1-1 and others)

[ Source: bifrost  ]

Bibliotek for parallel konstruktion, indeksering og forespørgsel af de Bruijn-grafer

Libbifrost er det delte bibliotek for kommandolinjeværktøjet bifrost for sekventering, der har en bred vifte af funktioner, såsom indeksering, redigering og forespørgsel af grafen samt inkluderer en farvemetode for grafen, der oversætter hver k-mer for grafen til genomerne de fremgår af.

 * Bygge, indeksere, farvelægge og forespørge de kompakte de Bruijn-grafer
 * Intet behov for at bygge de udpakkede de Bruijn-grafer
 * Læsninger eller samlede genomer som inddata
 * Resultatgraf i GFA (kan visualiseres med Bandage), FASTA eller binært
 * Grafrensning: kort fif-klipning etc.
 * Flere tråde
 * Ingen parametre at estimere med andre værktøjer
 * Præcis eller tilnærmelsesvis k-mer-søgning for forespørgsler

Other Packages Related to libbifrost0

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, arm64, ia64, loong64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [not arm64, ia64, ppc64el, s390x, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not arm64]

  GNU Standard C++ bibliotek v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download libbifrost0

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.3.1-1	388.7 kB	1,526.0 kB	[list of files]
amd64	1.3.1-1	417.9 kB	1,436.0 kB	[list of files]
arm64	1.3.1-1+b1	384.9 kB	1,325.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.3.1-1	509.9 kB	2,582.0 kB	[list of files]
loong64 (unofficial port)	1.3.1-1	384.3 kB	1,381.0 kB	[list of files]
mips64el	1.3.1-1	350.8 kB	1,504.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.3.1-1	428.4 kB	1,773.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.3.1-1	435.0 kB	1,644.0 kB	[list of files]
riscv64	1.3.1-1	424.2 kB	1,128.0 kB	[list of files]
s390x	1.3.1-1	430.1 kB	1,524.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.3.1-1	354.0 kB	2,125.0 kB	[list of files]