Balík: libbifrost0 (1.3.1-1 a iné)

Odkazy pre libbifrost0

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík bifrost:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs

Libbifrost is the shared library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.

 * Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph
 * No need to build the uncompacted de Bruijn graph
 * Reads or assembled genomes as input
 * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary
 * Graph cleaning: short tip clipping, etc.
 * Multi-threaded
 * No parameters to estimate with other tools
 * Exact or approximate k-mer search of queries

Ostatné balíky súvisiace s balíkom libbifrost0

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, arm64, ia64]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

podporná knižnica GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, ppc64, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie arm64]

štandardná knižnica C++ GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]
dep: libunwind8 [ia64]

nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť libbifrost0

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.3.1-1	388.7 kB	1,526.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.3.1-1	417.9 kB	1,436.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.3.1-1+b1	384.9 kB	1,325.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.3.1-1	509.9 kB	2,582.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.3.1-1	350.8 kB	1,504.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.3.1-1	428.4 kB	1,773.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.3.1-1	435.0 kB	1,644.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.3.1-1	424.2 kB	1,128.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.3.1-1	430.1 kB	1,524.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.3.1-1	354.0 kB	2,125.0 kB	[zoznam súborov]