Пакет: libbifrost0 (1.3.1-1 и други)

[ Източник: bifrost  ]

library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs

Libbifrost is the shared library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.

 * Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph
 * No need to build the uncompacted de Bruijn graph
 * Reads or assembled genomes as input
 * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary
 * Graph cleaning: short tip clipping, etc.
 * Multi-threaded
 * No parameters to estimate with other tools
 * Exact or approximate k-mer search of queries

Други пакети, свързани с libbifrost0

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, arm64, ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, ppc64, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не arm64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

Изтегляне на libbifrost0

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.3.1-1	388,7 кБ	1 526,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.3.1-1	417,9 кБ	1 436,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.3.1-1+b1	384,9 кБ	1 325,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.3.1-1	509,9 кБ	2 582,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.3.1-1	350,8 кБ	1 504,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.3.1-1	428,4 кБ	1 773,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.3.1-1	435,0 кБ	1 644,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.3.1-1	424,2 кБ	1 128,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.3.1-1	430,1 кБ	1 524,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.3.1-1	354,0 кБ	2 125,0 кБ	[списък на файловете]