все параметры
trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: bifrost  ]

Пакет: libbifrost0 (1.3.1-1 и другие)

Ссылки для libbifrost0

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код bifrost:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs

Libbifrost is the shared library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.

 * Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph
 * No need to build the uncompacted de Bruijn graph
 * Reads or assembled genomes as input
 * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary
 * Graph cleaning: short tip clipping, etc.
 * Multi-threaded
 * No parameters to estimate with other tools
 * Exact or approximate k-mer search of queries

Другие пакеты, относящиеся к libbifrost0

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка libbifrost0

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Версия Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha (неофициальный перенос) 1.3.1-1 388,7 Кб1 526,0 Кб [список файлов]
amd64 1.3.1-1 417,9 Кб1 436,0 Кб [список файлов]
arm64 1.3.1-1+b1 384,9 Кб1 325,0 Кб [список файлов]
ia64 (неофициальный перенос) 1.3.1-1 509,9 Кб2 582,0 Кб [список файлов]
mips64el 1.3.1-1 350,8 Кб1 504,0 Кб [список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос) 1.3.1-1 428,4 Кб1 773,0 Кб [список файлов]
ppc64el 1.3.1-1 435,0 Кб1 644,0 Кб [список файлов]
riscv64 1.3.1-1 424,2 Кб1 128,0 Кб [список файлов]
s390x 1.3.1-1 430,1 Кб1 524,0 Кб [список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос) 1.3.1-1 354,0 Кб2 125,0 Кб [список файлов]