[ trixie ]
[ sid ]
[ Источник: bifrost ]
Пакет: libbifrost0 (1.3.1-1 и другие)
Ссылки для libbifrost0
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код bifrost:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs
Libbifrost is the shared library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.
* Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph * No need to build the uncompacted de Bruijn graph * Reads or assembled genomes as input * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary * Graph cleaning: short tip clipping, etc. * Multi-threaded * No parameters to estimate with other tools * Exact or approximate k-mer search of queries
Другие пакеты, относящиеся к libbifrost0
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, arm64, ia64]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]
- вспомогательная библиотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, ppc64, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не arm64]
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- библиотека сжатия
Загрузка libbifrost0
Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|---|
alpha (неофициальный перенос) | 1.3.1-1 | 388,7 Кб | 1 526,0 Кб | [список файлов] |
amd64 | 1.3.1-1 | 417,9 Кб | 1 436,0 Кб | [список файлов] |
arm64 | 1.3.1-1+b1 | 384,9 Кб | 1 325,0 Кб | [список файлов] |
ia64 (неофициальный перенос) | 1.3.1-1 | 509,9 Кб | 2 582,0 Кб | [список файлов] |
mips64el | 1.3.1-1 | 350,8 Кб | 1 504,0 Кб | [список файлов] |
ppc64 (неофициальный перенос) | 1.3.1-1 | 428,4 Кб | 1 773,0 Кб | [список файлов] |
ppc64el | 1.3.1-1 | 435,0 Кб | 1 644,0 Кб | [список файлов] |
riscv64 | 1.3.1-1 | 424,2 Кб | 1 128,0 Кб | [список файлов] |
s390x | 1.3.1-1 | 430,1 Кб | 1 524,0 Кб | [список файлов] |
sparc64 (неофициальный перенос) | 1.3.1-1 | 354,0 Кб | 2 125,0 Кб | [список файлов] |