Package: ataqv (1.3.0+ds-2)

[ Source: ataqv  ]

ATAC-seq QC og visualisering

Et værktøjssæt til at måle og sammenligne ATAC-seq-resultater, lavet i Parker lab på University of Michigan. De skrev værktøjet for at hjælpe med at forstå om deres ATAC-seq assays fungerede, og gøre det nemmere at se forskelle, der er medført af biblioteksforberedelse eller sekventering.

Tags: Interface Toolkit: Ncurses TUI

Other Packages Related to ataqv

• dep: fonts-font-awesome

  Ikonisk skrifttype designet for brug med Twitter Bootstrap

• dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0)

  C++-repræsentaton af tidsvarighed, tidspunkt og ure

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  Filsystemhandlinger (flytbare stier, iteration over mappere etc.) i C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Bibliotek for Boost.Iostreams

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: libjs-jquery

  JavaScript-bibliotek for dynamiske internetprogrammer

• dep: libjs-jquery-datatables

  jQuery-udvidelsesmodul der laver pæne tabeller fra forskellige datakilder

• dep: libjs-jquery-datatables-extensions

  extensions for the jQuery plug-in for tables from different data sources

• dep: libncurses6 (>= 6)

  delte biblioteker til terminalhåndtering

• dep: libstdc++6 (>= 11) [not armel]

  GNU Standard C++ bibliotek v3

  dep: libstdc++6 (>= 12.2.0-3) [armel]

• dep: node-d3

  Datadrevne dokumenter til at visualisere data

• dep: node-normalize.css

  Moderne alternativ til CSS resets

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: macs

  Modelbaseret analyse af ChIP-Seq på korte læsesekvenser

• sug: picard-tools

  Kommandolinjeværktøjer til at manipulere SAM- og BAM-filer

• sug: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

• sug: wget

  Henter filer fra nettet

Download ataqv

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3,321.9 kB	6,513.0 kB	[list of files]
arm64	3,266.8 kB	6,464.0 kB	[list of files]
armel	3,239.7 kB	6,270.0 kB	[list of files]
armhf	3,253.4 kB	5,886.0 kB	[list of files]
i386	3,360.7 kB	6,658.0 kB	[list of files]
mips64el	3,263.9 kB	6,997.0 kB	[list of files]
mipsel	3,275.8 kB	6,980.0 kB	[list of files]
ppc64el	3,311.6 kB	6,849.0 kB	[list of files]