Balík: ataqv (1.3.0+ds-2)

[ Zdroj: ataqv  ]

ATAC-seq QC and visualization

A toolkit for measuring and comparing ATAC-seq results, made in the Parker lab at the University of Michigan. They wrote it to help understand how well their ATAC-seq assays had worked, and to make it easier to spot differences that might be caused by library prep or sequencing.

Značky: Sada nástrojov používateľského rozhrania: Ncurses TUI

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ataqv

• dep: fonts-font-awesome

  iconic font designed for use with Twitter Bootstrap

• dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0)

  reprezentácia doby trvania, časového bodu a hodín v C++

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  operácie so súborovým systémom (portabilné cesty, prechádzanie adresárov atď.) v C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  knižnica Boost.Iostreams

• dep: libc6 (>= 2.34)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libjs-jquery

  JavaScript library for dynamic web applications

• dep: libjs-jquery-datatables

  zásuvný modul jQuery na tvorbu pekných tabuliek z rôznych zdrojov dát

• dep: libjs-jquery-datatables-extensions

  extensions for the jQuery plug-in for tables from different data sources

• dep: libncurses6 (>= 6)

  zdieľané knižnice na obsluhu terminálu

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nie armel]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 12.2.0-3) [armel]

• dep: node-d3

  Data-Driven Documents to visualize data

• dep: node-normalize.css

  moderná alternatíva CSS reset

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: macs

  Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

• sug: picard-tools

  Command line tools to manipulate SAM and BAM files

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: wget

  sťahovanie súborov z webu

Stiahnuť ataqv

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	3,321.9 kB	6,513.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	3,266.8 kB	6,464.0 kB	[zoznam súborov]
armel	3,239.7 kB	6,270.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	3,253.4 kB	5,886.0 kB	[zoznam súborov]
i386	3,360.7 kB	6,658.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	3,263.9 kB	6,997.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	3,275.8 kB	6,980.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	3,311.6 kB	6,849.0 kB	[zoznam súborov]