Package: libhts3 (1.16+ds-3)

[ Source: htslib  ]

C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

HTSlib er en implementering af et ensartet C-bibliotek for adgang til fælles filformater, såsom SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM og VCF (Variant Call Format), brugt for sekvensdata med høj gennemløb, og er basisbiblioteket brugt af samtools og bcftools. HTSlib afhænger kun af zlib. Det vides at være kompatibelt med gcc, g++ og clang.

HTSlib implementerer et generaliseret BAM-indeks (binær SAM), med filudvidelsen »csi« (coordinate-sorted index). HTSlib-fillæseren kigger først efter nye indeks og så efter gamle hvis et nyt indeks mangler.

Tags: Role: Shared Library

Other Packages Related to libhts3

• dep: libbz2-1.0

  højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

  Simpelt adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden - GnuTLS-variant

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  Hurtig, fuld buffer DEFLATE-baseret kompression og dekompression

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Tilpasset kompression for CRAM og andre

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Kompressionsbibliotek for XZ-formatet

• dep: libssl3 (>= 3.0.0)

  Secure Sockets Layer-værktøjssæt - delte biblioteker

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download libhts3

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	419.5 kB	1,044.0 kB	[list of files]
arm64	382.7 kB	1,188.0 kB	[list of files]
armel	363.8 kB	1,123.0 kB	[list of files]
armhf	366.2 kB	931.0 kB	[list of files]
i386	458.0 kB	1,151.0 kB	[list of files]
mips64el	377.8 kB	1,301.0 kB	[list of files]
mipsel	393.9 kB	1,293.0 kB	[list of files]
ppc64el	453.9 kB	1,511.0 kB	[list of files]
s390x	381.5 kB	1,076.0 kB	[list of files]