Pakiet: ataqv (1.3.0+ds-2)

[ Pakiet źródłowy: ataqv  ]

Kontrola jakości i wizualizacja ATAC-seq

Zestaw narzędzi do mierzenia i porównywania wyników ATAC-seq, stworzony w laboratorium Parkera na Uniwersytecie Michigan. Został on napisany, aby pomóc zrozumieć, jak dobrze działały testy ATAC-seq, i aby ułatwić wykrywanie różnic, które mogą być spowodowane przygotowaniem biblioteki lub sekwencjonowaniem.

Znaczniki: Pakiet narzędziowy interfejsu: Ncurses (terminalowy)

Inne pakiety związane z ataqv

• dep: fonts-font-awesome

  iconic font designed for use with Twitter Bootstrap

• dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0)

  C++ representation of time duration, time point, and clocks

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Biblioteka Boost.Iostreams

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libjs-jquery

  JavaScript library for dynamic web applications

• dep: libjs-jquery-datatables

  jQuery plug-in that makes nice tables from different data sources

• dep: libjs-jquery-datatables-extensions

  extensions for the jQuery plug-in for tables from different data sources

• dep: libncurses6 (>= 6)

  Biblioteki współdzielone przeznaczone do obsługi terminala

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nie armel]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 12.2.0-3) [armel]

• dep: node-d3

  Data-Driven Documents to visualize data

• dep: node-normalize.css

  Modern alternative to CSS resets

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: macs

  Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

• sug: picard-tools

  Narzędzia wiersza poleceń do zarządzania plikami SAM i BAM

• sug: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

• sug: wget

  Narzędzie pobierające pliki z Internetu

Pobieranie ataqv

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	3 321,9 KiB	6 513,0 KiB	[lista plików]
arm64	3 266,8 KiB	6 464,0 KiB	[lista plików]
armel	3 239,7 KiB	6 270,0 KiB	[lista plików]
armhf	3 253,4 KiB	5 886,0 KiB	[lista plików]
i386	3 360,7 KiB	6 658,0 KiB	[lista plików]
mips64el	3 263,9 KiB	6 997,0 KiB	[lista plików]
mipsel	3 275,8 KiB	6 980,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3 311,6 KiB	6 849,0 KiB	[lista plików]