Пакет: flye (2.9.5+dfsg-1 и други)

[ Източник: flye  ]

de novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs

Flye is a de novo assembler for single molecule sequencing reads, such as those produced by PacBio and Oxford Nanopore Technologies. It is designed for a wide range of datasets, from small bacterial projects to large mammalian-scale assemblies. The package represents a complete pipeline: it takes raw PacBio / ONT reads as input and outputs polished contigs. Flye also has a special mode for metagenome assembly.

Други пакети, свързани с flye

• dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не alpha, ia64, riscv64]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [не ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: minimap2

  versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-six

  Python 2 and 3 compatibility library

• dep: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

Изтегляне на flye

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	2.9.5+dfsg-1	22 610,8 кБ	37 052,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	2.9.5+dfsg-1	22 656,8 кБ	36 930,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2.9.5+dfsg-1	22 576,4 кБ	36 729,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	2.9.3+dfsg2-1	22 763,6 кБ	38 428,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2.9.5+dfsg-1	22 574,7 кБ	37 033,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	2.9.5+dfsg-1	22 638,8 кБ	37 177,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	2.9.5+dfsg-1	22 648,1 кБ	37 113,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	2.9.5+dfsg-1	22 636,1 кБ	36 481,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	2.9.5+dfsg-1	22 685,9 кБ	37 085,0 кБ	[списък на файловете]