Пакет: covtobed (1.3.5+dfsg-2 и други)

[ Източник: covtobed  ]

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Други пакети, свързани с covtobed

• dep: bamtools

  toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g

  compression library - runtime

Изтегляне на covtobed

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.3.5+dfsg-2	45,8 кБ	211,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.3.5+dfsg-2	49,8 кБ	146,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.3.5+dfsg-2+b1	45,0 кБ	147,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.3.5+dfsg-2	42,8 кБ	125,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.3.5+dfsg-2	44,6 кБ	97,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.3.5+dfsg-2	45,5 кБ	123,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.3.5+dfsg-2	53,4 кБ	149,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.3.5+dfsg-2	57,1 кБ	240,0 кБ	[списък на файловете]
loong64 (неофициална архитектура)	1.3.5+dfsg-2	45,6 кБ	131,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.3.5+dfsg-2	47,0 кБ	137,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.3.5+dfsg-2	46,4 кБ	215,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.3.5+dfsg-2	49,7 кБ	210,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.3.5+dfsg-2	49,7 кБ	210,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.3.5+dfsg-2+b1	48,2 кБ	111,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.3.5+dfsg-2	46,3 кБ	138,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.3.5+dfsg-2	54,0 кБ	145,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.3.5+dfsg-2	39,5 кБ	1 045,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.3.5+dfsg-2	50,4 кБ	133,0 кБ	[списък на файловете]