Пакет: covtobed (1.2.0+dfsg-1)

[ Източник: covtobed  ]

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Други пакети, свързани с covtobed

• dep: bamtools

  toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [не amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: zlib1g

  compression library - runtime

Изтегляне на covtobed

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	44,8 кБ	137,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	39,7 кБ	121,0 кБ	[списък на файловете]
armel	40,3 кБ	120,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	41,8 кБ	92,0 кБ	[списък на файловете]
i386	48,5 кБ	144,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	43,4 кБ	155,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	43,8 кБ	149,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	45,5 кБ	209,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	40,7 кБ	133,0 кБ	[списък на файловете]