Пакет: biobambam2 (2.0.185+ds-2)

[ Източник: biobambam2  ]

tools for early stage alignment file processing

This package contains some tools for processing BAM files, including

  bamsormadup:  parallel sorting and duplicate marking
  bamcollate2:  reads BAM and writes BAM reordered such that alignment
                or collated by query name
  bammarkduplicates: reads BAM and writes BAM with duplicate alignments
                marked using the BAM flags field
  bammaskflags: reads BAM and writes BAM while masking (removing) bits
                from the flags column
  bamrecompress: reads BAM and writes BAM with a defined compression
                 setting. This tool is capable of multi-threading.
  bamsort:       reads BAM and writes BAM resorted by coordinates or
                 query name
  bamtofastq:    reads BAM and writes FastQ; output can be collated
                 or uncollated by query name

Други пакети, свързани с biobambam2

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, loong64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64el]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [не ia64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libmaus2-2 (>= 2.0.813+ds)

  collection of data structures and algorithms for biobambam

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

Изтегляне на biobambam2

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	9 150,3 кБ	73 920,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	9 203,8 кБ	64 327,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	10 230,3 кБ	117 346,0 кБ	[списък на файловете]
loong64 (неофициална архитектура)	8 614,9 кБ	62 743,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	7 602,0 кБ	75 740,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	8 944,3 кБ	76 579,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	8 815,6 кБ	51 675,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	9 225,9 кБ	60 999,0 кБ	[списък на файловете]