软件包：murasaki-mpi（1.68.6-14 以及其他的）

[ 源代码： murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

This package provides the MPI-enabled binary for murasaki. While this will speed up operation on multi-processor machines it will slow down on a single processor.

其他与 murasaki-mpi 有关的软件包

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost.Iostream 软件库

• dep: libc6 (>= 2.38) [除 alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支持库

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支持库

• dep: libmpich12 [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

  Shared libraries for MPICH

  dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [除 armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4, x32]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

  GNU 标准 C++ 库，第3版

  dep: libstdc++6 (>= 14) [除 ia64, m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

下载 murasaki-mpi

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	1.68.6-14+b1	638.1 kB	5,113.0 kB	[文件列表]
amd64	1.68.6-14+b1	676.9 kB	4,527.0 kB	[文件列表]
arm64	1.68.6-14+b1	581.3 kB	4,455.0 kB	[文件列表]
armel	1.68.6-14	492.4 kB	3,433.0 kB	[文件列表]
armhf	1.68.6-14	502.7 kB	2,429.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	1.68.6-14	627.1 kB	4,102.0 kB	[文件列表]
i386	1.68.6-14	685.4 kB	4,298.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	1.68.6-13+b5	766.7 kB	9,658.0 kB	[文件列表]
loong64 （非官方移植版）	1.68.6-14+b1	616.7 kB	4,501.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	1.68.6-14	634.2 kB	4,589.0 kB	[文件列表]
mips64el	1.68.6-14+b1	635.8 kB	6,005.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	1.68.6-14+b1	647.8 kB	5,927.0 kB	[文件列表]
ppc64el	1.68.6-14+b1	652.6 kB	5,735.0 kB	[文件列表]
riscv64	1.68.6-14+b1	629.6 kB	3,299.0 kB	[文件列表]
s390x	1.68.6-14+b1	657.4 kB	4,974.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	1.68.6-14	644.5 kB	4,173.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	1.68.6-14+b1	546.3 kB	13,466.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	1.68.6-14	647.4 kB	4,093.0 kB	[文件列表]