Pakiet: murasaki-mpi (1.68.6-13 i inne)
Odnośniki dla murasaki-mpi
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego murasaki:
- [murasaki_1.68.6-13.dsc]
- [murasaki_1.68.6.orig-debian-tests-data.tar.gz]
- [murasaki_1.68.6.orig.tar.gz]
- [murasaki_1.68.6-13.debian.tar.xz]
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Andreas Tille (Strona QA)
- Nilesh Patra (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]
Podobne pakiety:
homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)
Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.
Murasaki is an anchor alignment software, which is
* exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with 40 nodes: 52 wall minutes)) * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI. Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.) * unlimited pattern length * repeat tolerant * intelligent noise reduction
This package provides the MPI-enabled binary for murasaki. While this will speed up operation on multi-processor machines it will slow down on a single processor.
Inne pakiety związane z murasaki-mpi
|
|
|
|
-
- dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]
- filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
-
- dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [nie sparc64]
- filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
-
- dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]
- Biblioteka Boost.Iostreams
-
- dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [nie sparc64]
- Biblioteka Boost.Iostreams
-
- dep: libboost-regex1.74.0-icu67 [sparc64]
- Pakiet niedostępny
-
- dep: libboost-system1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]
- Operating system (e.g. diagnostics support) library
-
- dep: libc6 (>= 2.29) [sparc64]
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4, sparc64, x32]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.38) [x32]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libcrypto++6 [sparc64]
- Pakiet niedostępny
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- Biblioteka wspomagająca GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5) [sparc64]
- high performance message passing library -- shared library
-
- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [nie sparc64]
- high performance message passing library -- shared library
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie sparc64, x32]
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [x32]
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [sparc64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
-
- dep: murasaki-common
- homology detection tool across multiple large genomes (common files)
Pobieranie murasaki-mpi
Architektura | Wersja | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|---|
alpha (port nieoficjalny) | 1.68.6-13+b5 | 694,7 KiB | 5 701,0 KiB | [lista plików] |
amd64 | 1.68.6-13+b5 | 725,1 KiB | 5 095,0 KiB | [lista plików] |
arm64 | 1.68.6-13+b5 | 630,7 KiB | 5 159,0 KiB | [lista plików] |
armel | 1.68.6-13+b5 | 481,5 KiB | 3 423,0 KiB | [lista plików] |
armhf | 1.68.6-13+b5 | 495,5 KiB | 2 415,0 KiB | [lista plików] |
hppa (port nieoficjalny) | 1.68.6-13+b5 | 698,5 KiB | 4 822,0 KiB | [lista plików] |
i386 | 1.68.6-13+b5 | 737,6 KiB | 4 803,0 KiB | [lista plików] |
ia64 (port nieoficjalny) | 1.68.6-13+b5 | 766,7 KiB | 9 658,0 KiB | [lista plików] |
m68k (port nieoficjalny) | 1.68.6-13+b5 | 590,5 KiB | 4 246,0 KiB | [lista plików] |
mips64el | 1.68.6-13+b5 | 688,8 KiB | 6 877,0 KiB | [lista plików] |
ppc64 (port nieoficjalny) | 1.68.6-13+b5 | 715,8 KiB | 7 143,0 KiB | [lista plików] |
ppc64el | 1.68.6-13+b4 | 719,3 KiB | 6 503,0 KiB | [lista plików] |
riscv64 | 1.68.6-13+b3 | 676,6 KiB | 3 970,0 KiB | [lista plików] |
s390x | 1.68.6-13+b4 | 707,7 KiB | 5 742,0 KiB | [lista plików] |
sh4 (port nieoficjalny) | 1.68.6-13+b4 | 614,4 KiB | 4 250,0 KiB | [lista plików] |
sparc64 (port nieoficjalny) | 1.68.6-11 | 517,7 KiB | 3 959,0 KiB | [lista plików] |
x32 (port nieoficjalny) | 1.68.6-13+b6 | 709,0 KiB | 4 602,0 KiB | [lista plików] |