Пакунок: ncbi-blast+ (2.12.0+ds-3 and others)

[ Source: ncbi-blast+  ]

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Purpose: use::analysing, works-with::biological-sequence

Інші пакунки пов'язані з ncbi-blast+

• dep: libbz2-1.0

  Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль

• dep: libc6 (>= 2.33)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

  Lightning Memory-Mapped Database shared library

• dep: libmbedcrypto7 (>= 2.28.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedtls14 (>= 2.28.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libpcre3

  Застаріла бібліотека підтримки регулярних виразів, сумісних з Perl5 —виконавчі файли

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: ncbi-data

  Platform-independent data for the NCBI toolkit

• dep: perl

  Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Завантажити ncbi-blast+

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	2.12.0+ds-3+b1	11,644.2 kB	50,560.0 kB	[список файлів]
arm64	2.12.0+ds-3+b1	10,667.5 kB	49,066.0 kB	[список файлів]
armel	2.12.0+ds-3+b1	9,767.0 kB	41,076.0 kB	[список файлів]
armhf	2.12.0+ds-3+b1	10,020.6 kB	33,972.0 kB	[список файлів]
i386	2.12.0+ds-3+b1	12,566.7 kB	49,759.0 kB	[список файлів]
mips64el	2.12.0+ds-3+b1	8,641.6 kB	56,123.0 kB	[список файлів]
mipsel	2.12.0+ds-3+b1	8,748.4 kB	55,228.0 kB	[список файлів]
ppc64el	2.12.0+ds-3+b1	11,749.7 kB	61,741.0 kB	[список файлів]
s390x	2.12.0+ds-3+b1	10,451.1 kB	50,676.0 kB	[список файлів]