Пакунок: ncbi-blast+ (2.16.0+ds-6 and others)

[ Source: ncbi-blast+  ]

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Purpose: use::analysing, works-with::biological-sequence

Інші пакунки пов'язані з ncbi-blast+

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k, sh4]

  Підтримка бібліотеки, яка забезпечує вбудовані функції __atomic

• dep: libbz2-1.0

  Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль

• dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, sh4]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

  Lightning Memory-Mapped Database shared library

• dep: libmbedcrypto16 (>= 3.6.0) [not alpha, ia64]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedcrypto7t64 (>= 2.28.0) [alpha, ia64]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedtls14t64 (>= 2.28.0) [alpha, ia64]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libmbedtls21 (>= 3.6.0) [not alpha, ia64]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libmbedx509-7 (>= 3.6.0) [not alpha, ia64]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library

• dep: libnghttp2-14 (>= 1.28.0) [not alpha, ia64]

  Бібліотека, що реалізує протокол HTTP/2 (колективна бібліотека)

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22) [not alpha, ia64]

  New Perl Compatible Regular Expression Library- 8 bit runtime files

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.6.12) [not alpha, ia64]

  Колективна бібліотека SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [alpha, ia64, m68k]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [not alpha, ia64, m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: libuv1 (>= 1.33.1) [ppc64, sparc64, x32]

  asynchronous event notification library - runtime library

• dep: libuv1t64 (>= 1.33.1) [not alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32]

  asynchronous event notification library - runtime library

• dep: ncbi-data

  Platform-independent data for the NCBI toolkit

• dep: perl

  Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Завантажити ncbi-blast+

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	2.12.0+ds-4+b1	11,414.4 kB	59,755.0 kB	[список файлів]
amd64	2.16.0+ds-6+b1	14,885.0 kB	66,761.0 kB	[список файлів]
arm64	2.16.0+ds-6+b1	13,516.8 kB	69,382.0 kB	[список файлів]
armel	2.16.0+ds-6+b1	12,804.2 kB	57,042.0 kB	[список файлів]
armhf	2.16.0+ds-6+b1	13,063.5 kB	46,863.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	2.16.0+ds-6+b1	14,763.6 kB	70,272.0 kB	[список файлів]
i386	2.16.0+ds-6+b1	16,211.9 kB	68,311.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	2.12.0+ds-4+b1	13,417.0 kB	85,192.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	2.16.0+ds-6+b1	14,155.7 kB	61,829.0 kB	[список файлів]
mips64el	2.16.0+ds-6+b1	11,177.5 kB	86,558.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	2.16.0+ds-6+b1	14,677.8 kB	86,214.0 kB	[список файлів]
ppc64el	2.16.0+ds-6+b1	14,624.6 kB	79,174.0 kB	[список файлів]
riscv64	2.16.0+ds-6+b1	14,360.2 kB	56,113.0 kB	[список файлів]
s390x	2.16.0+ds-6+b1	14,165.3 kB	66,145.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	2.16.0+ds-6+b1	25,738.4 kB	176,611.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	2.16.0+ds-6+b1	12,238.6 kB	149,916.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	2.16.0+ds-6+b1	14,955.6 kB	60,947.0 kB	[список файлів]