Paket: tantan (51-1)

[ Källkod: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, works-with::biological-sequence

Andra paket besläktade med tantan

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, riscv64]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [ej armel, armhf]

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

Hämta tantan

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	41,3 kbyte	120,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	37,7 kbyte	144,0 kbyte	[filförteckning]
armel	36,9 kbyte	107,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	34,9 kbyte	79,0 kbyte	[filförteckning]
i386	44,5 kbyte	119,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	41,2 kbyte	149,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	43,9 kbyte	144,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	40,1 kbyte	92,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	44,5 kbyte	124,0 kbyte	[filförteckning]