Paket: tantan (23-1)

[ Källkod: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, works-with::biological-sequence

Andra paket besläktade med tantan

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

Hämta tantan

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	37,9 kbyte	106,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	34,8 kbyte	94,0 kbyte	[filförteckning]
armel	34,0 kbyte	93,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	32,8 kbyte	73,0 kbyte	[filförteckning]
i386	39,7 kbyte	105,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	40,2 kbyte	123,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	40,4 kbyte	117,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	39,8 kbyte	146,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	35,8 kbyte	106,0 kbyte	[filförteckning]