Paket: tantan (40-1)

[ Källkod: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, works-with::biological-sequence

Andra paket besläktade med tantan

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta tantan

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	39,3 kbyte	112,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	36,1 kbyte	144,0 kbyte	[filförteckning]
armel	35,7 kbyte	143,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	33,8 kbyte	79,0 kbyte	[filförteckning]
i386	41,9 kbyte	119,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	40,6 kbyte	150,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	41,0 kbyte	148,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	42,9 kbyte	144,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	37,5 kbyte	116,0 kbyte	[filförteckning]