Paquet : phybin (0.3-5)

[ Paquet source : phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Autres paquets associés à phybin

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libffi7 (>= 3.3~20180313)

  Bibliothèque d'exécution de l'interface de fonction étrangère (FFI)

• dep: libgmp10

  Bibliothèque arithmétique à multi-précision

Télécharger phybin

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1 537,4 ko	11 602,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1 926,3 ko	14 579,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1 799,7 ko	12 190,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1 807,4 ko	12 158,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1 586,5 ko	9 347,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	5 155,1 ko	56 961,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	3 415,4 ko	38 965,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	3 395,8 ko	37 296,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	7 441,9 ko	52 929,0 ko	[liste des fichiers]