Pakiet: phybin (0.3-5)

[ Pakiet źródłowy: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Inne pakiety związane z phybin

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libffi7 (>= 3.3~20180313)

  Pliki biblioteki uruchomieniowej dla interfejsu funkcji obcych

• dep: libgmp10

  Biblioteka działań arytmetycznych z dużą dokładnością

Pobieranie phybin

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1 537,4 KiB	11 602,0 KiB	[lista plików]
arm64	1 926,3 KiB	14 579,0 KiB	[lista plików]
armel	1 799,7 KiB	12 190,0 KiB	[lista plików]
armhf	1 807,4 KiB	12 158,0 KiB	[lista plików]
i386	1 586,5 KiB	9 347,0 KiB	[lista plików]
mips64el	5 155,1 KiB	56 961,0 KiB	[lista plików]
mipsel	3 415,4 KiB	38 965,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3 395,8 KiB	37 296,0 KiB	[lista plików]
s390x	7 441,9 KiB	52 929,0 KiB	[lista plików]