Paketti: phybin (0.3-5)

[ Source: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Muut pakettiin phybin liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libffi7 (>= 3.3~20180313)

  Foreign Function Interface library runtime

• dep: libgmp10

  Multiprecision arithmetic library

Imuroi phybin

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1,537.4 kt	11,602.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1,926.3 kt	14,579.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1,799.7 kt	12,190.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1,807.4 kt	12,158.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1,586.5 kt	9,347.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	5,155.1 kt	56,961.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	3,415.4 kt	38,965.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	3,395.8 kt	37,296.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	7,441.9 kt	52,929.0 kt	[tiedostoluettelo]