Balík: abyss (2.1.5-7)

[ Zdroj: abyss  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Značky: Pole: Biológia, Implementované v: C, User Interface: Príkazový riadok, Role: Program

Ostatné balíky súvisiace s balíkom abyss

• dep: bsdmainutils

  kolekcia viacerých nástrojov z FreeBSD

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.28) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  zdieľaná knižnica SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: make

  nástroj na riadenie kompilácie

• dep: openmpi-bin

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - spustiteľné súbory

• dep: openmpi-common

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - spoločné súbory

• dep: perl

  Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

Stiahnuť abyss

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	2,885.5 kB	8,774.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	2,716.8 kB	8,114.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	2,724.5 kB	6,470.0 kB	[zoznam súborov]
i386	2,960.8 kB	9,334.0 kB	[zoznam súborov]